2009年1至12月，凉山州环境监测站根据邛海水域情况，分别在邛海二水厂取水口、青龙寺、邛海公园、海河口四个监测点抽取水样对邛海水环境质量进行跟踪监测。
通过对邛海的水温、PH值、透明度、高锰酸盐指数、溶解氧、五日生化需氧量、化学需氧量、氨氮、总磷、总氮、氰化物、挥发酚、铅、镉、汞、石油类、氟化物、硒、砷、铜、锌、铬、阴离子表面活性剂、粪大肠菌群、悬浮物、硫化物、硫酸盐、氯化物、硝酸盐、铁、锰、叶绿素等32个项目进行监测分析：邛海青龙寺、邛海二水厂、邛海公园三个监测点均达三类水质以上，水质状况良好。邛海二水厂取水口水质达到饮用水标准。海河口为邛海的出水口，水位低，加之与海河相连，城市生活废水和水底淤泥对水质影响较大，总磷、粪大肠菌群或硫化物超标，水质轻度污染。
目前，邛海水体呈贫营养至中营养状态，整体状况较稳定，但各水期水质状况有所不同，以丰水期最好，枯水期次之，平水期更次一些。
